赣深高铁引入深圳地区有2套方案：引入深圳北站方案和引入深圳东站方案。
线路示意图
引入深圳北站方案（西线方案）：
从仲恺站出来后往西南走行，穿过银瓶山，在东莞市塘厦镇附近设东莞南站（原名：塘厦站）再往西南走行，沿广深港高铁走行以联络线方式引入深圳北站。
引入深圳东站方案（东线方案）：
从仲恺站出来后往东南走行，在惠州市惠阳区西北设惠阳西站，跨过深汕高速公路后折向西引入深圳坪山站。出深圳坪山站后沿杭深铁路走行，通过新建平湖南疏解区预留的杭深铁路与广深铁路的客车联络线引入深圳东站。
引入深圳东站方案败给引入深圳北站方案的主要2个原因：
1、引入深圳东站方案需要穿过深圳东部大量建成区，拆迁成本远高于穿越银瓶山、阳台山山区的引入深圳北站方案。（说是这么说，后面的深汕高铁走向还不是跟原来的东线方案深圳段差不多）
2、引入深圳北站方案在东莞设站可以兼顾东莞市的客流。（但是离市区真的远，所谓赣深高铁松山湖支线也没下文了）
如果选择引入深圳东站方案会有什么影响？
1、不管引入深圳北站还是深圳东站，远期都会引入西丽站。西丽设高铁枢纽是已经确定的。
2、引入深圳东站，列车也能到深圳北站，就像深汕高铁在深圳坪山站有联络线联通杭深铁路。
3、深圳坪山站有可能拥有3条铁路：赣深高铁、杭深铁路、深汕高铁。也有可能西丽站至深圳坪山站赣深高铁和深汕高铁共线。
4、惠州市惠阳区得到惠阳西站，东莞市失去东莞南站。光明城站失去赣深场。
5、没有莞塘广、莞塘深联络线，赣深高铁往广州不用走广深铁路，前面第2点提到的引入深圳东站也能到深圳北站。赣深高铁往广州的高铁车次走杭深铁路、广深港高铁。
6、不管哪个方案，深圳站都有往赣深高铁的车次。