1、第一个孩子未出世就已经死去，是甄嬛与皇上的孩子。彼时甄嬛刚刚得宠，华妃在宫中势头正盛，皇上出宫，华妃掌管后宫事宜，本就骄纵的她让甄嬛在毒辣的太阳下面跪了数个小时，让刚刚入宫，涉世未深的甄嬛流产。第一个孩子也就这样胎死腹中。
2、第二个孩子是胧月，也是与皇上生的。但那时甄嬛的父母被流放宁古塔，她对皇上又实在失望，心灰意冷之下不愿意留在宫中，拒绝了皇上给她升位分的打算，执意离开皇宫到感业寺去，胧月也交由了敬妃抚养，敬妃庄贤，也算是给胧月寻了个好归宿。
3、第三四个孩子是双生子，鸿瞻和灵犀。这两个孩子就是果郡王玄清的，那时甄嬛带罪出宫修行，却意外获得了真的爱情，她与果郡王开始禁忌之恋，并怀上了果郡王的孩子，但她怀孕后，却听到了果郡王离世的消息，为了掩人耳目，也为了救自己正处于水深火热的父母，为了给果郡王报仇，种种原因让甄嬛回到京城，并成功重得皇上恩宠，没想到果郡王并未遭遇不测，但一切已经不能重来。皇上识破后，让甄嬛赐给果郡王毒酒，甄嬛想借机自尽，被果郡王发现，果郡王自己喝了毒酒死了。最后甄嬛将自己和果郡王的儿子过继给了果郡王。
4、第五个孩子也是皇上的，但这个孩子是被迫得来的，甄嬛已经放弃了自己的爱情回到了宫里，她带着对皇上的怨与恨，对深宫的抵触回归，加入了尔虞我诈的后宫争斗，她明白自己要摆脱被人害的命运，首先就要自己强大起来，于是她也只得用自己的孩子来为自己谋前途，最终她牺牲了自己腹中五个多月大的孩子，将皇后扳倒。