“内肾外肾”学说认为，内肾主水，相当于西方解剖学中的泌尿系统。肾主精，相当于西方解剖学上的下丘脑-垂体-性腺轴系统，解剖学上的外生殖器官。内外肾在解剖上是相互联系的，生理、病理、治疗都是相互联系、相互影响的。男性外生殖器包括阴茎和阴囊，内生殖器由睾丸、附睾、输精管、射精管、尿道性腺、生殖管和附腺组成。
(1)阴茎
在古代医书中，阴茎的称谓很多，如茎、玉茎、茎、溺茎、阴茎、玉荚、裸子、势、阳峰、阴中燥、阳等。古人也称阴茎为“宗津”，如苏文《魏论》:“阴茎是阴茎的一种。”《苏文决论》:“前阴，筋聚之所，太阴阳明合之所”。把阴茎称为“精囊”或“精囊”的人，把这称为精液排出的精囊，如《意草》:“漏精是精囊的一种疾病。\” ; \”《灵枢穴真邪篇》说:“垂茎为体内之机，阴精之症，津液之道”。古人已经认识到阴茎是男性的性器官，具有射精和排尿的双重功能。阴茎上覆盖着一层疏松而薄的皮肤，有一定的活动范围和伸展范围，以适应阴茎冲动勃起时肿胀生长的现象。阴茎后部为阴茎根部，中部为阴茎体，阴茎体前部膨大部分为龟头(或龟头)。阴茎龟头和阴茎体之间有一个小的连接带，称为阴茎带。阴茎由两个阴茎海绵体和一个尿道海绵体组成，后者被一根称为尿道的细长管道所包围，其内口通向膀胱，外口位于龟头上。射精管、前列腺等。都是出口到尿道的。因此，尿道具有排尿和射精的双重功能。
(2)阴囊
阴囊这个名称，又称肾被囊、肾被囊或睾丸被囊，最早见于《安北后集方》。《苏文热论》云:“厥阴脉循肝中之阴器、络，故充满心烦、囊缩”“厥阴病衰，囊纵”。囊状挛缩是指阴囊挛缩，囊状纵裂是指阴囊松弛。《魂枢·刺结·真邪》云:“垂茎为机于身。”这里的“下垂”指的是包括睾丸在内的阴囊组织。阴囊状的囊袋，挂在人体的会阴部，内含睾丸等组织。由皮肤、纤维和肌肉组织组成的袋子是用来装睾丸的袋子。阴囊皮肤薄而柔软，高度敏感。阴囊的外层皮肤可以随着外界温度和内部温度的变化而膨胀和收缩，从而调节阴囊内的温度，有利于精子的产生和储存。阴囊由肌肉组成，肌肉由脾支配，故阴囊的疾病主要从脾论治，如《医林生墨》:“阴囊的疾病从脾论治。”但肝肾与阴囊的生理病理关系密切，所以阴囊的治疗要从肝肾两方面考虑。
(3)睾丸
在马王堆的医书《五十二病方》中，睾丸被称为“卵”。后来这种称谓也被沿用，有“精巢”、“丸”、“阴蛋”等称谓。如“灵枢致病的内脏疾病”和“小肠病人，小腹痛，睾丸控制在背部和腰部引起的疼痛。”《灵枢·总》:“厥阴之末…连舌头都卷起来了，蛋也缩了。”《苏文顾空论》:“腰痛不能抖，必引阴卵。”古人公认睾丸与“肾”关系密切，称睾丸为“外肾”。比如《妙方》:“癫痫患者，外肾硬肿。”就是睾丸硬肿。认识到生殖的本质是由“外肾”产生的。金元时期的医家张创造了“睾丸”这个名称，他的著作《儒林外史》中说:“睾丸是袋中之丸。”睾丸，位于阴囊内，一左一右，形似鸟蛋，产生生殖精气，是男性生育的决定性因素之一。这与现代解剖生理学的认识是一致的。睾丸是男性生殖的关键器官，产生精子，分泌雄激素。睾丸呈椭圆形，位于阴囊的左右两侧，中间被阴囊隔开。睾丸包含生精小管，精子在这里产生。曲细精管之间是睾丸间质细胞，产生雄激素。附睾附着在每个睾丸的上部。附睾是精子发育、成熟和储存的地方。
(4)精子室
精子室作为男性储精的一部分，最早见于《黄庭内经·长张念》:“急守精子室，不要白白放出去，关了就能长寿。”《云韵诸家齐发系七征·胎息根要》中记载:“精室，男藏精，女藏精以月水，乃长命之本”，明确指出精室是藏精之所。相当于西方解剖学中输精管壶腹、精囊腺、前列腺所住的地方。精囊位于下焦。精囊“位于直肠前，膀胱后，关元和气海之间”(类似经络附翼)。实质在形状上就像一个符机关空。功能上可化生和贮藏生殖精气，具有脏的功能，也可运化和排泄生殖精气，具有腑的特点。《医经·精气》说:“精气室是气血交汇，精气成胎之所，最重要。”“男人藏精的地方，尤其是肾部。”“西方参与医学激情”认为精室是精产生的地方，是精转化的地方。精液室的生理特征是精液的储存和溢出，既不隐藏也不被发现，而是在肾的秘固、肝的疏泄、心的主宰、脾肺的升降等脏腑功能的协同作用下保持动态平衡。